חדרים נקיים פרמצבטיים משמשים בעיקר לייצור משחות, תרופות מוצקות, סירופים, ערכות אינפוזיה ותרופות אחרות.עמידה בתקני GMP ו-ISO 14644 היא נוהג מקובל בתעשייה.המטרה העיקרית היא להקים סביבת ייצור סטרילית מדעית וקפדנית ביותר, תוך התמקדות בבקרה מדויקת של תהליכים, תפעול ומערכות ניהול, וביטול מוחלט של כל פעילות ביולוגית פוטנציאלית, חלקיקי אבק וזיהום צולב.זאת על מנת להבטיח ייצור של תרופות איכותיות והיגייניות.סקירה יסודית של סביבת הייצור ובקרות סביבתיות מדוקדקות הן קריטיות.מומלץ להשתמש בטכנולוגיות חיסכון באנרגיה בכל מקום אפשרי.לאחר שהחדר הנקי הוכשר במלואו, עליו לקבל אישור ממינהל המזון והתרופות המקומי לפני שניתן להתחיל בייצור.
